蒙古空军从1988年起继续按苏联的模式编制，在人员和作战部队方面大量裁员。从三个现役战斗团和运输及支援部队缩减成至今·现役空军义务兵约有1250人，无预备役兵力，包括1个战斗团，1个战斗中队，2个运输中队，1个直升机中队，1个训练分队。一些俄罗斯顾问和培训教员出于培训的目的可能会保留在蒙古国内。蒙古空军仅有两个空军基地：乌兰巴托和塞音山达；前者是蒙古空军基地的总部。蒙古国内遍布了大量的改建或部分改建的飞机场。
